1983年在原江苏工学院农机分院组建农产品加工教研室，并创办农产品加工工程本科专业;1997年学校组建生物与环境工程学院，设立食品科学与工程、制药工程、生物技术、环境工程和安全工程等5个本科专业;2006年3月学校为进一步加强优势学科建设，由原生物与环境工程学院食品科学与工程系、生物技术系和生物工程研究所组建现在的食品与生物工程学院。

　　学科建设：1986年获批“农产品加工工程”硕士学位授予权，1993年获批全国首个“农产品加工工程”博士点，1998年获批全国首批“食品科学与工程”博士后流动站，2003年获批“食品科学与工程”一级学科博士点、2003年获批“生物化学与分子生物学”硕士点、2006年自主设立“食品营养与安全”二级学科博士点，1998年获批“食品工程”工程硕士授权领域。“农产品加工及贮藏工程”是原机械部重点学科，江苏省“九五”、“十五”、“十一五”重点学科、江苏省“十一五”国家重点学科培育点。“食品科学与工程”2012年获批江苏省“十二五”一级重点学科。学科梯队两次被评为江苏省优秀学科梯队。2010年食品科学与工程学科获江苏省首批一级重点学科，2012年第三轮学科评估位居第8。2014年获江苏省优势学科A类资助计划。2015年全国博士后流动站评估获优秀等级。2016年第四轮学科评估为B+学科。2018年获江苏省优势学科B类资助计划。目前本学科支撑的我校农业科学、工程学、材料科学和化学等4个学科进入ESI排名全球前1%。

　　本科教育：现有食品科学与工程、食品质量与安全和生物技术三个本科专业。“食品科学与工程专业”是江苏省特色专业、江苏省品牌专业、江苏省重点专业，“食品加工机械与设备”和“食品现代检测技术”获批国家精品课程、国家级精品资源共享课，《食品机械与设备》、《食品加工机械与设备》、《食品现代检测技术》和《食品工程原理》分别获批“十一五”和“十二五”国家级规划教材，《食品机械与设备》、《食品现代检测技术》和《食品物性学》获批“十二五”江苏省高等学校重点教材，“食品与生物工程实验室”获批“江苏省高校实验教学示范中心”。2010年与英国利兹大学合作，举办2+2食品科学与工程国际课程实验班。2018年与澳大利亚莫道克大学签署了3+1本科生物专业合作办学校际协议。

　　研究生教育：现设有食品科学与工程一级学科博士点和一级学科硕士点，与生命科学院共建生物学一级硕士点。曾获得全国优秀博士学位论文1篇、全国优秀博士学位论文提名1篇、江苏省优秀博士学位论文7篇、江苏省优秀硕士学位论文5篇。2005年招收了我校第一位留学博士研究生，2010年至今的8年间共招收分别来自29个国家的博硕士留学研究生和留学博士后119人。

　　师资力量：现有教职工126人，其中专任教师110人。在110位专任教师中，正高31人、副高53人;具有博士学位教师103人、具有海外经历教师55人;博导25人、硕导79人。获省级以上荣誉教师50人次，其中江苏省特聘教授3人、江苏省教学名师1人。“食品物理加工技术与装备团队”2015年获批江苏省高等学校优秀科技创新团队。

　　科学研究：在农产品食品无损检测技术及智能装备、食品物理加工技术及装备、食品营养与健康、食品生物安全、食品生物工程及智能装备等领域形成鲜明的研究特色。2006年学院组建以来，发表SCI论文500多篇、EI论文200多篇、授权发明专利200余件、获得纵向科研经费1.2亿元、政府资助的学科专业及平台建设经费1.1亿元、部省级以上及行业科学技术奖30余项，2008年获得国家技术发明二等奖1项。建设有国家农产品加工技术装备研发分中心、江苏省农产品生物加工与分离工程技术研究中心、江苏省食品物理加工重点实验室、江苏省食品智能制造工程技术研究中心、江苏省食品智能制造装备工程实验室等5个省部级科研平台。一大批成果成功实现产业化，产生了显著的经济效益和社会效益。

　　国际合作：按照学校开放办学的思路，学院积极加强与国际同行的合作与交流双方互派留学生与专家学者，共同培养研究生，共同申报和承担国际合作研究项目。先后与美国加州大学、俄亥俄州立大学、英国利兹大学、日本三重大学、京都大学、加拿大Guelph大学、Saskatchwan大学、加拿大不列颠哥伦比亚大学等建立了长期友好合作关系。建立有中美鲜切产业研究院、中英农产品无损检测联合实验室、中美谷物科学与营养联合研究中心，是“世界食品保藏研究中心”的首批组建单位。